Com o trabalho da Educação Infantil, o Sistema de Ensino Universo tem a preocupação de oferecer às crianças um ambiente que propicie a cada uma e ao grupo. Uma real construção de conhecimentos, através de atividades contextualizadas, que desencadeiem cada vez mais o interesse pelo conhecimento. As atividades propostas têm o objetivo maior de oferecer a exploração, a descoberta e a construção de noções, ocasionando o desenvolvimento da criança e um maior conhecimento do mundo físico e social.
O Ensino Fundamental deve visar à formação de um sujeito crítico, competente para se inserir em uma sociedade que valoriza cada vez mais o conhecimento científico e tecnológico. Isso significa que a educação deve ser concebida de forma mais ampla, cuidando tanto dos instrumentos de aprendizagem essencial, quanto de conteúdos educativos. Essa forma de encarar as necessidades educativas demanda a satisfação dos pilares da educação ao longo da vida: aprender a conhecer aprender a fazer, aprender a viver, aprender a ser, visando à construção da cidadania numa prática educacional voltada para a compreensão da realidade social e dos direitos e responsabilidades em relação à vida pessoal, coletiva e ambiental, formando assim o sujeito crítico.
O Ensino Médio é a fase da vida escolar em que o aluno deve ampliar e solidificar os conteúdos, pois é a etapa final da Educação Básica. Em um ambiente agradável e com relacionamentos saudáveis o Colégio Universo proporciona este ensino ao aluno. Considera-se também para esta aquisição de conhecimentos a observância a Lei de Diretrizes e Bases da Educação Nacional e os Projetos Pedagógicos. Os projetos pedagógicos visam o desenvolvimento do conhecimento intelectual, moral e social. Alguns como aula extraclasse, feira de ciências, jogos internos promovem a interação entre as turmas. A Equipe Universo é dinâmica, competente e coesa, cada um desempenha sua função com a mesma finalidade, levar o aluno à conquista do aprendizado, pensando na sua formação integral. A carga horária é ampliada. As avaliações acontecem no turno vespertino e os simulados aos sábados. Na 3.ª Série é realizada revisão de conteúdos. As listas de exercícios são intensificadas e tem aula sexta-feira a tarde. O Colégio Universo defende a idéia da parceria e do companheirismo com os responsáveis pelos alunos. O quesito aproximação família/escola visa o real desempenho do educando.
Nos últimos anos, o ENEM se tornou a principal porta de entrada para o ensino superior. Junto com o aumento da importância desse exame, veio um novo desafio: a preparação dos alunos para uma prova que não avalie apenas conteúdos, mas sim um conjunto de 120 habilidades que juntas compõem 30 competências. Entendendo esse novo contexto, o Universo pré-vestibular traz desde 2016 uma proposta revolucionária de preparação para o Exame Nacional do Ensino Médio. Para isso, fechou uma parceria inédita com a empresa referência em ENEM na região norte do país: a Macedo de Castro Consultoria Educacional, que assumiu integralmente a gestão da Unidade pré-vestibular do Sistema de Ensino Universo.